1981 yılına kadar eğitim-öğretime açık olan Sincik Ortaokulu öğrenci yetersizliği nedeniyle Milli Eğitim Bakanlığı Orta Öğretim Genel Müdürlüğünün 19.08.1981 tarih ve 61053 sayılı yazılı emirleri ile kapatılmıştır. İl Makamının Emirleri ile okumak isteyen öğrenciler Kâhta YİBO ´ya naklen gönderilmiştir. Beş yıl kapalı olan Sincik Ortaokulu merkezdeki ve civar köylerdeki bilinçli velilerin yazılı isteği üzerine 1986–1987 eğitim-öğretim yılında yine Sincik İlkokulu eski binasında hizmete açılmıştır. Üç yıl eski okul binasında eğitim-öğretim verdikten sonra 1989-1990 eğitim-öğretim yılında yapılan yeni Ortaokul binasına taşınmıştır.05/05/1990 tarihinde Sincik İlçe olduğunda M.E.B. Orta Öğretim Genel Müdürlüğünün 03/09/1992 tarih ve 18478 sayılı emirleri ile Sincik İlçesinde Lise açılmasına karar verilmiş olup;1992-1993 eğitim-öğretim yılından itibaren 3 derslikli Sincik Ortaokulu binasında, bünyesinde Ortaokulu da bulundurmak kaydı ile ve tek müdürlük altında "SİNCİK LİSESİ" adı ile bir genel Lise açılmıştır. 1996- 1997 eğitim-öğretim yılında Lise olarak kullanılan bina Atatürk PİO 75.Yıl Erkek Öğrenci Yurduna dönüştürülmüştür. Bu tarihten sonra 1954 yılında yapılan eski Kaymakamlık, eski Karakol, eski İlkokul binası Liseye tahsis edilmiştir. Kaymakamlığımızın ve İlçe Milli Eğitim Müdürlüğümüzün; Sincikteki gençlerin üniversite hayallerini gerçekleştirmek adına ve hem çocuklarımızın, ailelerinin mağduriyetlerini gidermek için kız ve erkek öğrencilerimizin kalabileceği yerler tahsis etmesi Sincik Lisesinin öğrenci mevcudunu arttırmıştır.2002–2003 eğitim-öğretim yılında mevcut olan binaya ek olarak eski Atatürk PİO´nun binasını Liseye tahsis etmesi azda olsa sıkıntılarımızı gidermiş ama bunun yanında da dersliklerimizin 7 farklı mekânda olması gibi çeşitli sorunları beraberinde getirmiştir. 2009-2010 öğretim yılında yeni binada eğitim öğretime devam edildi. 26/07/2010 tarih ve 2778 sayılı makam onayı ile Çok Programlı Liseye dönüşmüştür. Okulumuz bünyesinde Genel Lise Alanı, İmam Hatip Alanı ve Çocuk Gelişimi ve Eğitimi alanı açılmıştır. Öğrencilerin çoğalması nedeniyle fiziki yetersizlik yaşanmış, bünyemizdeki İmam Hatip Alanı alınarak bizden ayrı olarak müstakil okula dönüştürüldü. Okulumuz 2014-2015 yılı itibariyle Sincik Çok Programlı Anadolu Lisesi olarak eğitim öğretime devam etmektedir. 

Okulumuzun yanında yeni yapılan kız pansiyonu 2013-2014 eğitim öğretim yılında teslim alındı. 2014-2015 eğitim öğretim yılında Kız Pansiyonumuza 173 kız öğrencinin alınması planlanmıştır. Pansiyonumuz mutfağında 2017-2018 eğitim öğretim yılı itibariyle yemek yapımına başlandı.